La masa muscular esquelética se reduce entre un 30 % y un 60 % tras una lesión medular, lo que se debe principalmente a la degradación de proteínas a través del sistema ubiquitina-proteasoma. En este trabajo, proponemos que el flavanol (−)-epicatequina, debido a sus amplios efectos biológicos sobre la salud muscular, puede prevenir la disminución de la masa muscular tras una lesión medular. Se distribuyeron aleatoriamente treinta y seis ratas Long Evans hembras en 5 grupos: (1) Lesión medular 7 días, (2) Lesión medular + (−)-epicatequina 7 días, (3) Lesión medular 30 días, (4) Lesión medular + (−)-epicatequina 30 días y (5) Grupo de control (solo laminectomía). Se evaluaron el perímetro de las extremidades posteriores, el área de la sección transversal muscular, el área de la sección transversal de las fibras y la expresión de proteínas del sistema ubiquitina-proteasoma, junto con la ubiquitinación total de proteínas. A los 30 días, el grupo con lesión medular perdió un 49,52 ± 2,023 % del área de la sección transversal muscular, mientras que el grupo tratado con epicatequina (−) perdió solo un 24,28 ± 15,45 %, lo que supone una diferencia significativa. Los marcadores del sistema ubiquitina-proteasoma mostraron cambios significativos. FOXO1a aumentó en el grupo con lesión medular frente al grupo simulado, mientras que la (−)-epicatequina redujo este aumento. En el grupo con lesión medular, MAFbx aumentó significativamente frente al grupo simulado, pero disminuyó en el grupo tratado con (−)-epicatequina a los 30 días. A los 7 y 30 días, MuRF1 aumentó en el grupo con lesión medular y disminuyó en el grupo tratado con (−)-epicatequina. La ubiquitinación global de proteínas aumenta tras una lesión medular; el tratamiento con epicatequina induce una disminución significativa de la ubiquitinación de proteínas. Estos resultados sugieren que la (−)-epicatequina reduce la atrofia muscular tras una lesión medular mediante la regulación a la baja del sistema ubiquitina-proteasoma.